Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGIP1Q9BQI5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms