Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms