Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms