Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIN3AQ96ST3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms