Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms