Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRERF1Q96PN7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRERF1Q96PN7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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