Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP3Q96P20 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms