Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NSMCE2Q96MF7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NSMCE2Q96MF7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms