Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTERF3Q96E29 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms