Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4CQ96CF2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms