Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM52Q96A61 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms