Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM54Q969K7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms