Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTTNBP2Q8WZ74 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms