Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms