Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms