Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MCOLN3Q8TDD5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms