Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELBQ8NG08 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms