Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms