Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC82Q8N4S0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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