Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC6Q8IVU3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms