Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms