Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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