Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms