Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC4Q7Z404 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms