Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms