Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms