Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PREX2Q70Z35 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms