Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms