Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms