Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms