Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RIF1Q5UIP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIF1Q5UIP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms