Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BEND3Q5T5X7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms