Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRFIP1Q32MZ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRFIP1Q32MZ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms