Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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