Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
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