Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2B3Q16720 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms