Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN3Q16667 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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