Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CTF1Q16619 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CTF1Q16619 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CTF1Q16619 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CTF1Q16619 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CTF1Q16619 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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