Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms