Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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