Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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