Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUM3Q15397 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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