Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3GAP1Q15042 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms