Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMD6Q15008 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMD6Q15008 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMD6Q15008 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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