Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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COL19A1Q14993 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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COL19A1Q14993 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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