Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms