Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SQLEQ14534 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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