Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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