Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBKEQ14164 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms