Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXOSC2Q13868 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms